《应用及环境微生物学》(Applied and Environmental Microbiology，简称AEM)为美国微生物学会所发行的双周科学期刊，具同侪审查机制。本刊物创始于1953年，原名《应用微生物学》(Applied Microbiology)，1975年改为今名。本期刊属于延迟开放获取期刊，发行前六个月需要付费注册才能阅读，六个月后转为开放获取，意即读者可以免费下载论文。根据期刊引证报告(JCR)，该期刊2014年的影响因子为3.668。该期刊在微生物及医学领域，为过去百年最具影响力的100种期刊之一。现任总编辑为拜罗伊特大学的Harold L. Drake。
本期刊的专业领域包含应用微生物学，包含生物技术、蛋白质工程、生物修复，以及食品微生物学。 微生物生态学，包含环境微生物学 跨领域微生物学，包含无脊椎动物微生物学、植物微生物学、水产微生物学，以及地理微生物学。